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+
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tcttatgaaaactagaaaactgggactctttctagtaaaagtcatattctgattccaataggcattatattgacaagtgggagttttgagacttgaaataagaggtagacactactaaatgtggaaggagatgcatcatttccaagttttctaattcctttagatacacctcaaatctcctataaaaactagaaaacttggactctttctagtataagtcatattctgatcccaattagcattatattgacaagtgggagttttgagacttgaaaaatgaggtagacactactaaatatggaaggagatgcatcatttccaagttttctaatttctttagatacacctcaaatctcctatgaaaaccagaaaacttggactctttctagtaaaagtcatattctgatcccaattagcattatattgacaagtgggagttttgagacttgaaataagaggtagacactactaaatgtggaaggagatacatcatttccaagttttctaattcc
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ACTATCTATTTTATATGTGCATGTGATTATTTCTATTGATTGTTGtagttaaaaaatatatataaaaatatacatgtcAAATGTGATTATAAGCGAACTGCATATTTTCTTGTGCGTGGAAGGAAAACATATTTGTGTCTTGATTCTATAACATACGATATCAGCATATTACCtaaaatttttgtataatCGGAAATAAAAGATAACTGTCCGTAATGATAATGTTGAGATAGCATCATTACAAAGTTAACACAGTTGAAAATAACacatgtaatatatattcaatttaattGAATTATTGGTCCACGcgaattatttataaaaaaataatcacaaGACTTGGTGATGTTTTAGGTTTAATGAGTCCCAGTTAATTCTACAGCTATGGAGCTTTCACCAAACCCTTCTCATGGGGCCCTGGCTATCTGGACCTCCATCCATGCATCTGCACACAAAAACATtattcaatattatatatatatatatatatataaatatatataatttgaaag
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GCF_000463585.1
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tatatatatcagtttaaatcaaatattatcatttaattCTACGTGTTTGGATATTTTATTCCCTTTCATCAATAAGAGTTAAACAAAAAGCAACCAcgacgattttttttaaatgcacaaaaaaagaggaagaaagaaTTAGATTAATATGTTAATTCAATttcgatataaaaataaaattaaaacaggaaaaatgaaaaagtttGACgtgtaaatataaatatgatttaaatTTGACCAAAGGAGATTTCATAGATGGACCATAAGTTAGACCGTCACTATCACTCAAACATCATCAACATCGCAATCTCGATAtacacttcttcttcttcttttgcccTTTTTCGTTGGTTCTATTGATTAATAAACCACATGGAAACACAGCTTTTTATCAGCCGTTTTTCATCTGGTGAAGTCATGGACGAGGCTACCAGCCCTGTCCGCCACGTTGAGCCTCCAGGAGAGGAAGGGCGCGGCGTCGGAGTCACGGTGGTGGTAGTCGCCGGCGACGT
|
GCF_000478725.1
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NW_006256342.1
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|
-
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aataagaaaaagtagttaaagaaaaagatgatgatgaaaatgaaACTCAAGACGAcgaaaaagaataagaaaaaaaaagaagatgaaaaaatcaaaatataaaaaaaaacatgtagaTGAAGATGAAATAGAAGATGAAAAATACATACACGAGATAAgtaaatataagaaaaacaaaattagaaaaaaagatgaagaaaaacaaaaaaaagaaaagatatagaagttgaagaagatgaagatgaagaaaagaaggataaagaaagagaggaagaagaactcAAGCTGATGAAGAGGAATTTAAGAAAATACGAAGGCAAAAATGTTAAAGATGAGAAAGGAGAccgaaaatgaaaaataatatattatcttaatatgatgatggagaaaaagtataataaaatcaagaaaataagaaaaaaatatgatgaattagctgttgaaaaataaaatatgatgaAAATCTATACCcacaaaatttaatattaacatatatttaaaatatatatata
|
Taestivumcv_ChineseSpring_725_v2.1.softmasked.subgenomeA
|
Chr3A
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*
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AAGCATACTTTAACGAACTGAGCATAAGGTACACGTTGACTGTTTGGAAATCTGAAGTATAAAGCGAATCCTGGCTTATTTCCACATTCACGCTCATATATTGCTTCATCACTCTGCAGAAAGTTGTATATGCAAACTCATAAGCACTAAAACAATGTAATAACCATCAGGAAAGCTGTTGTGAAAAGTGTACAGCACATGAATCAAGAAGCTACCTTCCAATAGTAGGCCATCTTCAGTGTCTCATGAAGAAACCGTCCAAGCCTACCAGCTTCATATTCTGTACAACAACAGATCATTGGCTGTAGTGTCTTGCAGATGAAAACATCTATATGATTCACCGTGTTAAAAAATGGAGTTCCCAGTGAATGCATCGTCTTGACAAATGTAGCACAATACACAGCATCCTGCATGCTAAAAACGCAACGTGGATATATACAACGCTGGAGAAACTCCATGTTGATCTTCAGTGCGTCCGGACCAGAACTCAGCCATTTATCCTTTTCACGGGC
|
Taestivumcv_ChineseSpring_725_v2.1.softmasked.subgenomeA
|
Chr2A
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*
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TGTACTATGGGACTCCTGGGGATGATGTGATCTGTGATTTGGAGGGGGTCCTTGGGAGGCTTGGGGATGCAGTCAAGGGTAACCTTCTTGAGTTTGGGAAGGTTCTACAGCAGGAGTCGTCACGCCGGCCTATGATGGCTGGTGAGATCCACCCAATCACACGTTATGTGATGAACTATCTTAGGCTGTTGGTCGTTTACAGTGATACGCTTGACAAACTCTTGGATGAGGATGCTGCCGGAGATGCTGATCATAATGCTTCAAATGGAGGTGCTGATGATGACGAGGAGTATCTGAAGAGCTTGACCCCACTTGGACATCGTTTGGTGAAGCTGATGTCTTACTTGGAGGCCAATTTGGAGGAAAAATCTAAACTGTATGAGGACGGTGCACTCCAGTGTATATTTTCCATGAATAATACACTTTATATTGTCCAAAAGGTGAAGGATTCCGAGCTCAGGAGGATTTTAGGTGATCATTGGACACGGAGGCGCCGTGGAAAGATTCGGCAA
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|
GCF_000375325.1
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-
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|
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chr11
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*
|
CCCAATCATGCAATGCCTGTACACATATATGGACACGATGGTGCTCGCTGGGCTCCAAGAAAGAAGCGTCAGATCGTCTTCGGCTAGCTTCCGGCGGCGTGTGCGTGCGGCGCGATGGCGGGGCAGGGGCAGCGCCTGAACGTGGTGCCGACGGTGACGACGCTGGGCATGGTGAAGGCGCGGCTGGCGGGCGCGGCCCGCGGCCACGCGCTGCTCAAGAAGAAGTCGGACGCGCTGACGGTGCAGTTCCGCGCCATCCTCAGGCGCATCGTGTCCGCCAAGGACGCCATGCGCGCCGCCTCGCTCTCGCTCGCCGAGGCGCTGTACGTGGCCGGCGCGCCGCACCGCCACGCCGTGCAGCACTCCGTGGCCGGCCCGGCCGGGCTCCGCGTGCGCGCGCACCAGGACAACATCGCCGGCGTCCGCCTCCCGCGCTTCGAGAGCTACCTGGCTGACGGCGCCGCCGTCAACTCGTCGCTCGCCGGGCTCGCCGGCGGTGGGCAGCAAGTGTC
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-
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ATATGGATGGATCATTCATACGTAATTAATATGagttgaattttttttgaaattcaaAAAGTTATGATAACCGATCATTAATCATTTTGATTGTGAATAAATACTACTAGTTGAATGATACAGGGTTTAACATAACGTATGGTTTTAAAATTGATATATAGCCAATGGTTGAACCGATAATAGTTTTCGGTTAAATCAAACCGGTATATTTGGAACCGTGCAGCTGAGAATAATTACCCGTCAggaaagagaaaggaaagagaagagaaaaagaaaagacccAAACTTTGAGAAACACCTTCATTCTCTTCCCATCAAAGCTTCCTTTTATCCTCGTTTTTTCAATTCGcgtgaagagagagagagagagagagagataaagcaGAGGAGAGAATCGACATTCGATTACGCATTTTTGTCCCAGATCGCCAGGAGGAGTGGGAAGAACGAAGATGACTATTGGGGTTTTCTGTGTTTCCCTGTTTCAGCCCTGAATTGGAtctttccttatt
|
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+
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gccaaaagctggATGCGGAAGGCAACATAATTTCTAAATTCGTTGTCCCTGCTGAACagaaccttggtgtcgatcgacgccaacaagagggtatcgatcgacacccccttcctgcagacggacgtggagctgcaaaCCACGTAATAACCCGGTTCGAAGACATGAGCACAACCGAgccttgatcaggaccattgctgactacaaccgggatgatattgtgtatgagaaccggtctgctattgttccacccccattccagaggaatgactttgagctgaagaTTGCTTACTTTCagctagttgggcagagacctttctcaaacctgcccaatgagaggcctttggaccacattgagcattttgaggatcttgtgaccaatataaaggctaatggagtgactcaggattacatctactgcaaactttttccttactcacttgcaggagaggcatctcagtggttgaagcagttgccaaCTGGATCTTTGACGAATTGGTGTGACATCAAGGTGG
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+
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-
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TTAAACATCTTATGATCGTAAAGTTACTACATTAATCATGTCATGGGTCGCGCGTAACACATAGTTTAAAGAAATAGCACACAATTTGGTCTTgtcatttaatttaataaagcCCTGCTTACTAGACTGATATTGGAAAATTAACTAATTTGGTAATGATGGTACAGGAAGATTAGCAGGGAACGTTGTAATGAGTGGGAAAGTTCTAGTTAATGGCAAGAAGAGAAGACTTGACTTTGGTGCTGTCGTAAGCAAACCTATCCTTTAGCTTTAGCTTTACGCAATCAAACTCTTATTCATGAATGTTATAAACCCTGAATCatgtatgtttttcttttgaaactGTCGAGAAACTCTCAGGCTTATGTGACACAGGAAGATGTGTTGCTAGGAACTTTGACAGTGAGAGAATCAATATCTTACTCAGCTCATCTCAGACTCCCATCAAAGCTTACCAGAGGAGAGATCAGTGACATTGTGGAAGCTACAATCACTGAAATGGGTCTGCAAGA
|
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|
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-
|
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|
GCF_000478725.1
|
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|
+
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|
GCF_000801105.1
|
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+
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attgaaaaatcagATGTCcgtaaaatacaaaacaaatcacaaaactcaaaaaatactAATCAGTGTCCATTTCTAGTTAGCAACATCTTAAAGAAATAACAGTAAAATCTAGTAGTGAAGCGTTACATGGTTCATTGTTAGCCCGTGGACATTGACCACGTAGAGTTATATAAATGGTTTTAGTAACTAAAACATCTAACTAAAGACAAatcgataaaaaaaaacctcaactaaaaaatttacaaaataaactttcACTTTTAGTTCAATTTACCTTTCGTCCAAAATATCGTGACGGAGTGTaacaatttttaacaaaaataaaattgatggtttattttataggatttttagTTGAAGAATTTTATTACGATTCATCTTTAAGGGACTTAatcactaaaatcataaaatgttctaaaatatttgCTATCATTTctgcaatttttaaaattgatttataagctcttatattgtttaaaattgatttgtacgattcatttctttttaaagat
|
GCF_000150535.2
|
NW_019014691.1
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+
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ACAAACCCCTGCGGAACTCTGTTTTCCTGCTCTCTGCCGGCACCGCTTCACTCCACTTAGaaatcttctcttttttcttccctaCTTTCCCATCTTCTGTTTTCTCACCGACAACCAATTCATTCAATTTCACTCGAAAGTTGGATTCATGACTAGGGAAGGCAAAAAGTTCGTTCAACTTTAGCCAATTTGTTCATATTCATCTTGGATTTTAACCGAAATTGATTCGGAtcagatttttatttaagtgaTATCGGAATAGGGTGAGTTTAAcccaataatatatatatacaaacacacaaatatacatatataataaaacctccttatatatatatatatataaaagctgcttctttatatatatatatatatttaatacagcttccttatatatttatatatgtatatataagctGCATAGTACagatacatatctatatatacaaaagCCCTTCGATTAATGCTTCCGCtggagctatatatatatatatatatatgaagaaacCTGT
|
Td-FL_9056069_6-REFERENCE-PanAnd-2.0a.sm
|
chr9
| 6,960,385
| 6,960,896
|
*
|
ggtctttccctccccggccgttttttttttttaaaCATCTGAAACTTCTACTCTCATATTACACCAGCAGCTGGTCAATACATGGAAAAGATGAATTGTACATGGTCAGATACACAGATGACACCTAGAGTTTGTTGATTCTGCGGAAAACAGATGTACTGTAACAATAGCCAAGCCTAAAAGGCTAGTGCTCAACTTCTATTTGCTTTGTTTAAATTGAGCATATTAACTTCACAAAATATTTCTGTGTAGAACAGATTTCCAGATGAGCTGTTAGGGTAGAAAGGTCCCCACAACCAATAACAGGAAACGTTGAAGCAGGAGAGAGCATGCATGACAGACTATTTTTTGTTGAGTTCAAATTATGGACAAGTGAGTTGCTGTATTTACTTACTATCTTTCCAACAGGAAATATTCCAAAAATGCTGAAGCAAACACAACCATCTTTGCCACCACTGCACAGAATGTTAAAACGCTGACAGGAAGCACTACAAAATTCTGGAATAGCTTCT
|
Taestivumcv_ChineseSpring_725_v2.1.softmasked.subgenomeA
|
Chr4A
| 428,436,993
| 428,437,504
|
*
|
CAAAATCTGAATCATCAGAGGAAAAGCTCGATGTTTTTAAACCTTTCGGATTATGTTGACTGGAGGAGTCTGCCCTTTTGAACAAAGGGGTATCCAGAACAACTCCTCCTTTTTCATCATTTACACCCTTCCTCATCATTTCATTCAAATTGCCACAAGCTTCAGTCTCTATTGCATTCAGGTCATCCCAGTCATCAGTAAGTTGTGTTGCATCAGCCAATGCAGCAATAAAATCATCGCCGCAGTTCTCCACAGTGATGAAATCTTGGCCACCCTCTCCTGTGCCAGAACAATAAATTATCGCCCATACATAGTATCAACCAGCAAGAAGTGAACCCAAAACTACACTGAAGCAAAAGCAAAGCATAATGTGTTAACTATGGGTGGTACAGTTTATCCAAAAGCATCAGAAACCTCAGCACTAGTCACTTGATAATTCAATATAAAATGCTGCCGAAAACTAAACGTCTAAGTCAGCATACTGAGCAGGTTTCACTGATTTATGTTGTGAA
|
GCF_000463585.1
|
NW_010968009.1
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| 37,697
|
-
|
catggcgtcttgctagaggccaaccatgacttgtggttcgggaaaggttcctaaagtcactaccacttagaatgggcctacaaggtcacacaccattagggatagacttatatgtgaagtatcggaaaggaagacttggatttggtcgaacaaacggtttttcggatcaaatcagagtgtcgggatgaATTCAGCGttctgactcagaccgagtcagtatttgactcggatcgagtcaGATACATGCGAGtcaaagcccagaaagtgtatTGGgtttggctgatgttttgagtcggacgagtcaaagttttgactcagacagagtcaatactcaatgggccgagtcgagttgacaatgggcttgggctgattcgttctgactcgaccgagtcagagttctgactcggaccgagtcaatactcggaaaaagtctcttttcacaaggattaggggttctaacttataaggaggtgttgacGTCGTCCTAAGAGTATAACTCACTTTAAGAACcc
|
GCF_000633955.1
|
NC_025687.1
| 24,124,932
| 24,125,444
|
-
|
TTTTTTAGAACTTCGCAGATGTTAGTAAATTTCTTTATGTTATGAATCTTTTATGCCATTATTAACGTGACTCAATTGTTTTCTGTTGTAttttcatatcatatttttcGAAACTTACTCATGATTTCAGTTTGTATAAATTTTCTTGTGCGGTATTTTCTGAAATCGCAGGAAGAATGATGAGTTGCGGAAGGATGCTGTTGACGCACTATGCTGCTTGGCTCATGCACTTGGAGAGGACTTCACCATATTTATTGAATCAATTCACAAGATTTTGCTGAAGCATCGATTACGGGTTTTGCATTAAActatcttttaaataaaatagcacttgcagtaaaaaaaacttttatccTGTAGGtgtataaatttcattattgtATATTTCTGTCTGTAAAATCTCACTTTACAACATTTTTGCAGCATAAAGAATTTGGGGAAATTCATGCTCGCTGGCTGAGACGTGAACCGTTGATTGTAGCTTCAACTGCAACTCAACAATTAAGTAGGCG
|
GCF_000463585.1
|
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| 2,492
| 3,004
|
-
|
CATTTTTTACATtcatattttaacaaaaatcacGATttctagaagaaaaaaattgtacatattgagtttttgttttggttttttaggttatgttttttattttgttgaaaGTTATTTTCATTGAATTATTGAAATCTATTTAatctgattttaaaaaatagatataaacaaattctaaattagatttgatttacatatatttatatattattagttaCATTTATTTATCTAAATAGTCTTAGTTTCGGTTAGAATCCATATTAGAAATTTTAACCCATTAGTCAAACCCAGATTCATGACTGCCTCAGTCCTTCATTAGCCACgatgtaaataaataaataatttaatttaaaattaagaaCGATGATCACGACAATAATTACGCGACTTGGTCAAAACAAATACATTAAtagtatgtttttttaataagaatACTGACCTCTTACACATTTGAAGGAGCGGTCTGTTAAAACATGTTATAATGTTATTATCCATATTatagtgttatatat
|
GCF_000463585.1
|
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|
-
|
tttgagattttgttCGGTGTGAATAAAATTTTCTCTTCAGTTTTAGTtctgaaataaaataacatatagAACTCGTTTACGTTTGATTTATCACTCAtctgattattattttttgaccTTAAAACGATGTTAAATATCAGCAAATATCCAtgaataaaaattcaattacGTTTGAGTTATCACTAATCTGATTATTCTTTAAACGAGGATAATATCCATCTCCAAAAATCGGCTAGTTAATTTTCATTCAAATTCTTAAcctatgatatatatatatatatatatattatcttcaAACCATAAGATTAAGCACATAAGCCGtaacaagaaaaatatattaaacagAGACccctttatttaaaaaaaaacaatatatatatatatatatatatatatatatatattaaaaggcggattgaaataaaacaatatagaaaaggcaaaaaaatgaataaattatGGAAAATCTATGGAGTCCTGAATTGTAAATTTGAGAAAGAAACGAGTCCTTG
|
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|
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|
-
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|
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|
-
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CTTCCTGGTTTGCTTCTTCAGAAGTTTCCTTGAAGGAACCTGAAAGCCGAGTCATTCCTCTGCAAGTCTCTTGTTGCGGTGCGCCTGTTCTGGTTGTAGCAAAACCAGGCATTGCTGAGTAATCAGCTATGGATGAAACCTTTTGAGAATCTTGGTAGTTCCTTCTACCCTTTGCGGAAGCAGATCTACGTGATAGAGGACCGGAATGTGAAGCTCTCTTGTGAGGAATAATGTTACCCTGAGACTCTCTGTTTGGTTCAAATGCTTGTGATGATGGCCTCGGTGGATCAATTGGGAAACCAGATGCAACTTCTTCAGGATGAGGATTAAACTTCTCGCTTCGGCTTCTATTAGTAGACTGGCTCTGCCTTTTCTGCATAGGATAATGCAAGAGAGTGTCAAAACATAAAAGCAAGAAGCTTTCACATCGAAAGATATAATAAGCTTGGACTAAAAATTTAACCTGCATTGATGTAACAAGCTCTGCATTTGCGTCAGGGGCTGGGATAGCC
|
GCF_000633955.1
|
NC_025696.1
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|
+
|
TCTAATCCGCAGATCCTCGTGAATCCGAGACGCTCAAACCAGTAGACTTTCACCACGGCATGGAAGTTCGGCTTGGTCTCTCCAAAGGCCCAGCTTGCCCAAGTTTCATGTAGAGTCATATTTTTCATCTCTAGGTCTCATCATATGCTTCAAAATCCTCAATCTGAGTAAAGATCATGTCATGAAATTTTCATATTTCCTAAAAAGAATCTACTCGTTTGTTTGATCTTTTCTCTACATTGTTTGTCCTCCTCTGCTCTGAACataaaaatctaagaaatctGGTTCAGTTCTGAACTTTGGATGCTAGATTTtgttcttataaaataaggaatgTAAATAGattaatactaaattactaaacaaacaaaaaaaaaacatcggattaatctcaaacaaaacaaaaaatattatcacgtaaataaattataattaaaaaaaaataaaaaattaaagaacccTATTCTTCGTTTTTATTCGATCCCCAGAAACGAAAAAGATTTCATAATAAT
|
Td-FL_9056069_6-REFERENCE-PanAnd-2.0a.sm
|
chr15
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| 2,746,880
|
*
|
TAGGTTGTATCCACCTTCTACTAGCTCTAGCTAAGCTCAGTTCCTTCATTCGAAGATATTATTCAATGATTTGTATGTTAGGTTTAATTGTAATAAGTGATGAAAGAACAAGAAATGCTGCAAGCTTGTTTTATTTTATAAAATACTGAACAAAATCTTGTGTTCGATTGCCCAAAACATACCAACACCTTCTCTGAATAATTCTGGAACTAGAATCAGTTAATAACCATGATAAGAATTGTTATTCTAAGAGGATGGATGGTGTTCCCCTATCTTTCACATGATGTAAGTTTGCATGCAGGAAGCTGGAGAGATCCTCTCGAATATGAATCATCCAGCTGGGGATTGTCCATTGTGTCTATATGCTCTAGTGGGAGAGGATAAGGTTGGATCTGAGTTGCCATTTATGAAGTTGATGTCATGCTACCACTGCTTCCACAGGTTGAGAAAGCTGTACAATAGTGCAAGCAATTTCTTCTATCTACTCCTACTTTGTAGGTTATACTTTTGCA
|
GCF_000478725.1
|
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-
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TAAAAATCCTGTTTAGAGATTCACGAGGATGCTTTTGTTGGATCACTTCCTTGATAATTtgaatgtaaaaacaaaaacggtttgtgattttctttttctcttcaaaaTTATCAGACTTTTTGTTCAACTAAAGTTTCCCTTCAGTGAAAATTACAGGTACTGGAATTCAACGAGAGAGCAATCTAACTAGCGAAGGGAAGattctcttctttttataTTCTGTTTTGGCTACTACTAGTTCTAAACCAGAGTCTAAGAAAATATTATCTGAactaatattctttttaatctGTAAATCATTGAAATCATCCTCATGTGTTGTGTATTGAAGTCGAGGGTCACTCAGTTTTCGAGGAATTTATTGTATTCTTTATCACCTAGTACAatactaatattttttgtccttttgtttttgtagaTAAGATTTCAACAGAAATACTGTCCATTTTGTTCATTtcacttattattttttgtaaggTAAAAATcctctatttttcttttggacGTATGAA
|
Bdistachyon_556_v3.0.softmasked
|
Bd1
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|
*
|
gcaccgccaccgtgtctctgcggcacctctcggtgtgggctcggtggagggatgcggcaagggcgcgacggcggtgcacccgtcggcgctaggcgctgatgggatacaccaccatcgcgcctctgcagcaccgcccgccctcttagcctcttggctgtgctcagagccgtcccatggccaggattctccttttataggcgcggaaggggggggggggcttgccaccacacacaccgggtcaacgcagtatacgtggcgccccgccccttggagtgcggtacggccttcgccactccgcatgccaagctgctgtggcacacggggcggcttcctcctgaatcaggggcctcgaagtgcggcgagtccctcgtggtgcggtcgctccgcaccaccaggcgttgctacatgccgcggcccgtgggcggtccacgagcattacagtgcgcaagattccacctttaccctgcacattagattcttaccaagcccgagatgctgcaaaaaaattcgaa
|
Sviridis_726_v4.0.softmasked
|
Chr09
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|
*
|
TGAATTTGAATTGGTCACTATAAACATGGATGTCTATTAAACTTTGTTAGTTAAAATATTACTATTTGATTGTAGCCTATAGATATGTTCTGTTACAGTTAATATACATCTAAATTCAAGTAATGTGTTCTGTTAAACGTACTTTTATATTGCTTGTGTCCCTGGTTTGCTGCACTTGTTTGCCTGAGATTACTGAATGATACTATGGTTTTTTACTGTGATTGTTTTTCTATATTTGATAAGTTGAGTTTTCAACATCAGGGAGAGGCAAAACAGGTATCCAAGTGGTGTGCGTGGTGTTTATCTGAGCAATTGCTAAATGATAAGATGATTGTTTATTGTAAATTTTTTGGTATATTTGATAAGTTGAAGTTTTCGATTTGATGAACATCAGGAAAAAGCAAGCGTGGCGAGCTTAGTGTATTCCCACAGAAATTTGTTGTGCTCTCTCCATGTCTTCATATGATGCCTCGACAGGTGAGAATCAAAACTGAATTCAAATAATTATTTCT
|
Td-FL_9056069_6-REFERENCE-PanAnd-2.0a.sm
|
chr5
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| 64,327,680
|
*
|
TGCACGACGACAATTTCTCAGAATATTAAGGACTCTTCCATATGGGAACTCTGTTTTCTTCAGTGTTCGGAAGATTGATGATCCTACCCAGCATAGGGAGAATAAATAAGAATGTCGAGATATTATACCAGATAATTTTGTGCCCTTGAGCTGGTTAGCAGCTTGTTGGCTTCACATCAACTGCTTCTTTTAATCTTCTCTCAGCTCGACTCCCTGCATATTTTCCTCTATGGAGAGGTAAGTCTTCATCTTTCTGCATTCATATATCAAGTTAAGATATGTAAAATTATGGCCAGGTGGTGAAAATATTTCTAAACAAGCAAAGACGCACCAATTCCTTGAACAGAGGTGCGGGTTTCCCTGTTTTGTAGATTGGACATTTGTGTGCACTATTTCTATCAGTTCACTGGCGCATACAATGCGTTGACAGAATTTTGTGTATTTTCAGGAGTGAACGTTGATGACGTTCGAGTAACAGTAGCTGCCCTTGCTGCTCGACAGGAAGCTAACAG
|
Osativa_323_v7.0.softmasked
|
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|
*
|
ATTCATGAGTACTTGAAGCAAGGGAATGCCTTCTCAATTCCATGTGTCTTGCAGGTTTTGACCATTTCAAGAATGTTGAAGCATGACAACATTGTCCAAATTCTTGGATATTTTATTGAAGGGGAAAATCGTGTTCTTGCTTATGAGTATGCACCAAAGGGTTCCTTGCACGATATTCTTCATGGTAAGGAATAACAAAAGATTTTTACTTTGACATATTCCTATCTTGCTTGCTTACTGTATTATGATCAATAGCTGAAATAATATGATTTTTTTACTACATTACTTTATGTGTTGAATTGCTTGTTGCATTACTCAAGAGGGTGTCAGAGGAGCCCAGCCAGGAACACCTCTATCATGGGAGCAGCGAGTGAAGATTGCTCTAAGTGCTGCAAAAGGGCTTGAGTTCCTCCACGAGAAGGCTGTGCCTCCTGTCATCCACACCAACATCAGGTCCAACAACATATTTATCTTTGGCAATGATGTTGCAAAAATAGGTGACCTCGGCGTCT
|
Osativa_323_v7.0.softmasked
|
Chr10
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|
*
|
CGAGGCTTCTGACCTTGGTTTAGAAGCTGGTCACTGCAAGGTATTTATGGAATCGGAGGACGTTGGTCGCACCATTGATTTGTCTGTCTTTGGGTCATACGAAGAACTGTATGGTCGGCTGGCTGACATGTTCGGAATCGAGAAAGAAGAAATCATAAACCATCTTCATTTCCGTGACGCAGCTGGTGTAGTCAAGCATCCGGGTGAGGTACCATTCAGGTGAGGACCTCATTATCATATCGTTAGTTTTTTTTTCCCTTACAATCCTCTAACAAGTTTATTGCGATTGCGATGAGATATATCTAATCCATTCTATTTACGTTATAGTGACTTCATGAAAGCGGCACGGAGGCTTACAATAATAGCCGGCGACAGGGAGAGAATTGAGAGACCTCTCATCGAATGCTTAGTTGAGCAGGCGTGATAGTTCAATAAACTCCCGTTTGAATTTAATTCTGAAATATGAATCGTAGCGTGAAAAGACTTCCTTTGTTACATGTACTTGCGTTGGG
|
GCF_000478725.1
|
NW_006256756.1
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|
+
|
TTGCCTTTTACCTACTCAATATCTAGCAAAAATTAACATTCTCGAAAACATCTATGTTAATTCTCATCCATATCTCTACAGGAACATCACCAACTGGTTTTTGGATTCTAATTTTCTCAACTTGTCCTAAGATTCTTTATTTATTCTATCATTAGTTGATTATTGCTTTGATTGGTTGGCGGAATAATGGAAAAAAATTTGCGAAATAAATTAATCTACGTATAAATTGCTTTTCTGCAGAAtgactttttatattttttaagtgAAACAGCAGTCTGCGTTTTGTGTGTATTTTATCATTCCGCAAATTTTTGTTGAATAACAAAAATCTTGCGGAATCGTATTTAAAACACAATTCTACTATTCTATAAGTTACCAATCAGAGCCTACAAACCTAGTTGAATACCTCAAAGAAAGTATGGATAATTTCTTCCAGTCCATTTATTTACGGTAAGCATCCATTCCTTGAAATTCCAAAGCTCATGCTCGATCGCAGCTAGCATATGATGTTC
|
GCF_000478725.1
|
NW_006256909.1
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|
-
|
AAACGACTGATAATAATCCAACTTCCAACATTAACGCGCGAATTTGCAATTGATCATCTTTAACTGTGGTCTGAATTTTTTCACACCTTGAAAAATCACATGTATTTTTATCTAAGAACAAAGCATTTTTTATTAGATATCacctgaaaaaaataatttttttcttttgatataaTAAATACATGTTCATCGGATAATATGACCTCCAAAAAAGAACGTTTGGAAATTAGCCGATGCATCCACGTCTATAAAACCATAAAAAATATAGTACAATCAGCTTTCAAGGGTCTAACAAGAAACACACCCCCCAAAATACATTAAGCCAAGTGGCACCGTATAAGTCCAAATAGGAGCCTGGTGGCCTGAAACACTAATATCATTTCCGATGAGTATATCGTCCGACTTAACACTATGATGATCATCTACATCGTCATTGCTCTCAGTCTCATCATTCGActcaacatcatcatctttgtcaCCATCATCGGTGGAGTCAGCACtgtcttcgtctt
|
GCF_000375325.1
|
NW_006238917.1
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|
+
|
TCATCCCAATCAACGTtgtccatttctttttttccagaGTCATACCAATCGATCATACGGTTACCATTTCTATTCCAACAATAAAACACGTCCTCTATCACACAGTAAGCTGATGAGCTACCCCATCCATCATTCATCTCTAAGTCTGCCTCTATCCATCTACCATTATGAAGCTTGTGAGTCACATTTTTATCCCGAGACCTCACATAGATAGTTCCTTCATACCCTATGCTTTCGTATCCATTGCCTATGCATATCTCCTCGCTAGGGATATGCATAAACTCCcaagtttgagtttttgtaTCAAAAACCTCCATCCATTTTGTTGGATCAAGATTTTTCTGGCCTCCTGCTACATATATTTTCCCATCAAGAGCGCAAGTAGATTGGAACACACGGGCTACCTTCATGGTTGGGGCCTCACGCCATGTGTGAGAATGACAGTCCATAACTTTGACGTTGAACGAAGGATGCTTACTATTAGGTTTGAATCCGCCAATGGAGTAGATGTT
|
Osativa_323_v7.0.softmasked
|
Chr11
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|
*
|
cgtatattataggaccctagctagtcaataattatatactaagtctaattacatgcatgataatcttatattaaaactcaaataattattgtctaaaactcaaatagtcatgtatgctaagtgtaactgtcgtatattaacaccctacacaatcttatatgctaagtctaattacaaatctaataatcttatactaaaactcaaatagtgatatatgctaagtctaagtgtcgtatattaaatctaatagtcttaattgcattagaaatataacaatcatatatataattacgtcacttgcctgcgcaaattccttcgagggctagctaccactccggcttgagggacgactccgacaacgtcttttctgcaagatacaaaaagatgtattaggataaacgcaaagtaacatatattgcatttgatgttcacgtttcgttcacgatcgttcacgttcgcgttctcgttaaggtcacgtttcattcacctacgttcgttcgttcacattcgtt
|
GCF_000309985.2
|
NC_024799.2
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|
-
|
TCTCGAATTGTATATCAGTCTTTGATGTTAATACTTTTGTTGCCAAATTCAGGCTGTATGATCTATTCTGGAAGCATTCTGATATCGATTTGTTGAAATTGCTAATAAAGACGAAGAAGCATAGCATAATTAAATTGACTACCTagctatattattaaaatatacttattTCCTGTAATTTATTTAGCGTGTTTCAATTACTGAAACCGAAAACTGATCTTTCGTATAGTGGGATTGAGTACAAAATACCAATCTGGGAGGAGGGGGGCAATATATTACTAGTATGCAACAtcaaatagattaaaaataatgaaagcATTTCTCTAAAAACAGGATTGTATTAAATGAAAGCACTATTCGTTTAAACGTTACTAATTtcatacatttatatatttcagaGTAGAATCAAAACTTCCTTTCTCATTTTTAGGTTGTAGTATATTACTACTAGTTAAAAGAGGAAAATACAATACCAGTAGTAGTGATATATTACTACTAATACTTATATTCCA
|
GCF_000478725.1
|
NW_006256486.1
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| 12,198,502
|
-
|
CGAATCTTACTTACACCATTACTCCTGATACAGCTGGTTCTGAATCATTAATGTCCTGAAACAAGTAAAGCACTGTCATCGAAAATAACCTTTGAAGTTAGACGAAGCACATAGCAGAAATGGACTCACTGTGAAGAAATCAAGATACTCTTTCTGATCATATTGCTTCTCCCTCACTTCCAAATGCTGAACAAAGAATCCACAAAGATTACACAATTTTGATGGAATTTGTAAtgattgttaaaaaaaaaagagaaatcatAATCAGCTTACTGTTAAAGCatctcttttgtcttcttccttgGTTATCTTGTAAGCAACTCCCCACTGTGTGTGTTTCATTTTGTAAGCAACATTAAGAAAATAAgagaattttgattttgaaatgTTTAGATAAAGGCTTACACAGATTTCTCCATGTGCAGGCTCCAATGTCACTGTTCTTCCCGGAAATTCTGGAGTTCCTCTATGATCAGTACTACCTAACATTCTAAATTATCAAAAAAGATCGT
|
GCF_000633955.1
|
NC_025694.1
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|
-
|
aaatacattttttttttcaaccaaacattaatctagaaaacaattccaaggttggttgcccaaaccaGAGGGAAAGAATTTCCCAAACCAGaggaaaagaattttaaaaaaaatttcagaggATAAAGACTTTGAAGAacgagcaagacaatctgcccgTACATTTGACGTCCGCGGGATCCTCGAAAGTATGAAGGAAGGAAAGGATGGTCGGAAGAAGCTGAAAGCATCCAACAAGTTGGAGAAGGCGGGCCATTCATCGGGAGACTGCACCATAGCCACTAATTCTGCACAATCTGTCTCAAAACTCTGACAGTCAACACTTGCCACCAATAGAGACTCTATCGTCCAAATCAAAGCGTGAAGCTCCCAATGTAAGGGAAAATGCCATTTTTATTGTATACAAAATAGTAACATATATAATCATCATTAATAAAACAGTTTCTAAACCTATTCGTTTTTGTGCTCATTTTCCTCGTCTTGCTTTGTCTTTCTTtgttacgaaaaaaaaa
|
GCF_000801105.1
|
NW_017353144.1
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| 47,682,234
|
-
|
CTATCGTCTTTCCCTCGGTTTACGATTCCTCGTTCCAAGGGTTTACTGAACCGGACCGGTTCGATCCGGATCGGTTTAGCGATGCCAGGAAAGAGGATCAGGTGTTTAAGCGAAACTTCTTGGCGTTCGGGTGGGGACCGCACCAGTGCGTGGGCCAGAGGTATGCGTTGAACCACCTTGTGCTCTTCATCGCAATGTTCTCGTCGCTGTTGGATTTCAAGAGGGTTAGATCGGACGGGTGTGATGAGATCGTGTATTGCCCCACGATCTCGCCTAAGGACGGGTGCACGGTGTTCTTGTCTCGCCGCGTCGCAGCGTACCCCAACTTTTCGTTgaattgattttgaatattctgtgtttctattttttcttttgcgtGTGGTTAAAGTGAAGAGTgtgattttatcatttttttgtttgtgatttgtCTCTCGAATTGAGAGGTCTTCAAGTGTTTATTGAATTGGATTTGATAGGAGGTGTCATTGTTTGTCATATCTTCAAGATTATTT
|
GCF_000463585.1
|
NW_010961290.1
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|
-
|
ATTCGTTTACGGAATAAGGAATGGAAACGAATCAGAAAAAGATGTTCTTTTCCGTTTCTCACTTATTTACCCAAAGTGCCATGAAAACACGTACACCGATGGGGATGAATCAATCATGCTGTGCATGAATGAAGCAGTTGGATCGTCCTGCAGGTACGTTTTCAGTCGCAATCATTCCACGAGAAGTTCTATTAAAGTCGATCATAGGGAGAGAGAAGATTAATGATCCAATCACAGCTCATCATACTTTGAGCATCTGTATATGGACGGCGCTCGAGATTGAAGAAAACAGAGGTTGATAAATCGAGATTGAGCAACTGGGTTTTCATGATAATCGCACATAAGCTAGAGATAATCCAAATGAAGCAAATGGGCATCTACGATAATCAAAACTAAAATCTGGGTGTTGGTGAAAATCATAACTTGGCAAATGGGTTCGTAAGAGAATTATAGTAGTCGAATGGAACATTACCTGTGCTTCTCAGTTACTAAATCGCCATGAAATCAAATGa
|
GCF_000633955.1
|
NC_025700.1
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|
-
|
ccaagacttaacaaaatgtatttatagtaaaaacatgtaaatctctaaaacttaaaacgacaaggtgaagaGTTGGATTgagaatctcctgaagcgtgtaagacagAACGTATTCTTGACATGTGCGAATGAGTCGGTGTGCGACCAGTCCTCGATTGGTATATGAAAGTGCCTAGAATGATGtgagtgaaagtggctcgagcgtggttggtgaaagtggctcgagcatggtcggtgaaagtggctcgagctggatgtatacacatccactaaaacgatgataactcttgaacgacacttccgattggcttgaaacaAACAGcgttggaaagatgactcaattccctacaactttaatttatacgtcaaaagataattatcactcgagtggaacggctcgaacggggttgtgagattggctcgagagacggttccggaagtgttgtgagattggctcgagagagggtTCCAAGAATGTTGTGAACTTGGCTCGAGAGAGGGTTCCGAGAGTG
|
GCF_000633955.1
|
NC_025686.1
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|
-
|
TTGTCGGTAATGGAGTTACCCGTCGTAGATCTGTCTTGTTACCTTGAATCATCCGGCGACGATTTGGGAACTGATCTCCTCGATTCGTGCCGAGAAGTGAGCCGGATCCTCAGAGAAACCGGAGCTCTCCTTGTCAAAGATCCGCGATGCAGTGCTCAAGACAACGATCGATTCATCGACATGATGGAGACTTATTTCCAAAAGTCGGATGATTTCAAACGACTCCAACAGAGACCTCATCTCCACTATCAGGTTTCGTTTCCCcctttcaaaaaagaaaaagaaaaaaaatcgaatctttgATTAACCCATCacattcaatttcaatttctagAATCTGAGTTAAGCCCAATGGTTAGGGTAAGATTAGGGCACAGATcttagtgttgttgttgtttgaaaaagtttcaatcttttaaaattaaggTTGGTGTGACGCCGGAGGGAGTTGAAGTTCCTAGAAGTTTGGTTGATGAAGAGATGCAAGAAAAGTTCAAGACTATGTCTGACGA
|
Sviridis_726_v4.0.softmasked
|
Chr09
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| 48,351,232
|
*
|
CGCGGGCGACGGGCTGCGGCCGCTGCCCGGCGACGTCCAGCACCTCCTCATGGGGTCCGGCTTCCACCGCCTGCTGGACCAGTTCTCGCGGGAGGCGGCGGCGCCGCGACCCCCGGCGTCGAAGGCTGCGGTGGAGTCCATGCCATCTGTGACGATCGCCGGAGGCGGGGCCCACTGCGCGGTCTGCCAGGAGGCCTTTGAGCCCGGCGCCGCCGGGCGGGAGATGCCGTGCAAGCATGTCTACCACCAAGACTGCATCTTGCCCTGGCTCTCCCTCCGCAACTCGTGCCCCGTTTGCCGCCAAGAGCTTCCGGCCGCGGCCACCCCAGATGCGGAGGCGGATGCGGGGCTCACTATCTGGCGACTTCCACGCGGTGGATTTGCCGTAGGGAGGTTCGCCGGCGGGCCCAGAGAGCAGCTCCCGGTCGTCTACACCGAGCTGGATGGGGGCTTCAGTAACGGGGTCGGCCCGAGGAGGGTGACATGGCCAGAGGGAGAGAGGCAAGTGGATG
|
GCF_000633955.1
|
NC_025685.1
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|
-
|
gaagagatcaatgaTGCTGATCAGACAAAGAGTGACCCTGACTATTCTCCTGATAGTCCAGACACAACAACGATCTCTGTTGAATCTGCTGAGGTGTTCAATTAGTCCGCCACCACAAGCAGGAAGAGAGGTTATAAGAAACATTATCCTTAAAAACGTTTACTTGTTAGGATCAAACTCTTCTCTGTTTCAGCTTTGTTAGGATTAATTAAACTCTGTTTGAGTCTTGTTATTCTCACTCtttgtactctctctctcaatgAGTAGCACCTCTTAAACTTGCTTACTCTTGGGAATCTTGCTTCTCTTTTCTAATATGATCtaactttaaaatcaaaaaagacACGGGGAGTTTTAATGAGTTCAGATCTCAACTCACTTATATATTCATCTCCATCATCTTTACAAGAGTTACATCAAAAACTTCGGTGTCTTTTGAATCACTCagagttcttgaagatcttgAAGCAGATTAAGAGCTTGATCAAGCCCTTAAGATATTCCCAGTTAGT
|
Sviridis_726_v4.0.softmasked
|
Chr09
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| 46,728,960
|
*
|
CAGCAGAAGAAACAACATTTATCAGTTGTTTCGCTTGCTGCTCGATCTAGTTTTTTTTGCTATTTTTCTTCTCATTCTGTAGACACTTTCTTCCTTCAGTGTTCTTCTACAGCCAAACTATTTCCTCCCTTTTTTCCTGGTCATTCGGTCCAATCTTCCAAGCAGAAGCTAGAGAACGGAGAACTACCATAGCAAGATCTTGGTTCTGTTTCATTTGCATCAGTTCAGCTGTGTAGAATCGATCCGAACTTGAGCCAGCAAGATTCCCATCTTTAGGAGCCCTCCAGCTGCCTTCTTCAGGAAGTTGAAGTTTCAGCAGCAGAAGGAAAAGCCCAGTCTCCAGCGATGGCGGCGGCGCTGGAGTGCTGGTCGGGGCGGCCGAGCACCGACGAGGAGATGGTGGAGCAGGTTCTCATGAAGCCCCACGGCCGCTCAGACGACTCCCTCCCAACCTGCGCGGACTCTGCCTACACCGGCGAGCCAACGTCGGCGCCGGCGCCCCCCAAGAAGTG
|
GCF_000463585.1
|
NW_010967707.1
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| 5,911,388
|
+
|
GTATTGAAACAGTAACTAACGGCTtctgattgatgttttttgtttttgcatttTCGTAATAATTTTGTTGGGGGTTAGCGACAAGTACATGCAGCAGATTGCAATAGAttaatgaaaatattaaaaaaaagatcaataGAACGCATTAGTAGAAAATGCCATTTGTATTTccgaaaaaaattatccaacttttttttaacaaaataaagaCATAAAATCAGTATAAGTTCCTAAACCCAAGTTTATATTGAAAAATCATagggtaaaaataaaatatgtgaAAGCAGGTTCTTTGAACAAAATAATTGGTTTAGATAgtctatatattatgatttgaAATGTATCATTGATAAGGTTACATTAGTAATGGTAATTgttcaaaaataatttaaattaagtATGATTCGCTTTGTCTCCATCGTCAGCACCAGGCACGGTGCTCAGCCCTGCCAGCTCAGCGTGgccgaaattaaaaaaacaataaaattcgAGGAGCTTGTAAGCCACGTGGC
|
Osativa_323_v7.0.softmasked
|
Chr4
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|
*
|
AAGGTATCGGTAAATGCACTTCTTTTCAGCATCCGACTTTTCTGAATATTGTGGCTTATTTTCTGCTGTCTTTTAGGCTGTACTTTGGAACATGGAGACTTTCCAGACACAGTATACTGCTGAAGAGCATGCTGTCATTATCACTGATGTCCGTTTCAGACCTAACTCTAATCAGCTGGCAACATCATCTTTCGATAGAACTATTAAACTGTGGAATGCTGCAGATGTAAGTCATGATTTTTCCTGTGTGTGTGAAAGTGGGAAGGAGATTACCCAATTATGCCTGGAGTTATGCTGTCCATAACACTAATTCTTTCTGCGCCGTAGTACTGACTGGCACACACTTTCATTTAGAGTACTGATCATTGCAGTATATGTCATAACAAATATACCATGACACTACTGTCTTGGAATTGACAGTATAAGGCAAGACCAATTTGCAAACGAACTAGTCTGTAAGCTATAGTATATGTGTGATTATGGTTTTGGTCTATTAGCTAATTGTAAAGTTA
|
Sviridis_726_v4.0.softmasked
|
Chr09
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| 6,232,832
|
*
|
CAATGCTGAGATGACCCCACACACCACATCAAGACGTCGGAGGAAGAAGTCGCTAGTCTGGGAGCACTTCACTATAGAAAACATGCCAGGGGGAAGCTCAAGAGCATGCTGCAATTTATGCAAGCAAACCTTTGCGTATAGTTCTGGTTCAAAAATTGCAGGCACTAGCCATCTCAAGAGGCACATCACCCTCGGTTCCTGTCCTGTTATGAAAGACCAAGACAGGAAGCTAGCACTGCCACCACCAGGAGGCCCTGGCACTGATAATGATGGTGAGGGTACTGTAGAACGCCCTTTGAAGAGGCGCTACAGATACACTGGTTATGCAAATGCTACTTTTGATCAGGAAAGGAGCTTCTCTTATCTGGCTAAGATGATTATTTTGCATGACTACCCGCTTCACATTGTTCAACAGTCAGCCTTTACTACTTTTATTGAGAGTCTGCAGCCCCGTTTCAAGGGTGTAGATGTTGAAACAATGGAGGGAGAGGTTTATGCTGTTTTTCAGAAAG
|
GCF_000001735.4
|
NC_003070.9
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| 634,991
|
-
|
ttttaaaattaatgagAGCACATTTGTGATTTGTTGTATATCACACTCGATCTATTTCTTTATGCCGCGTGGATGCCAAAGTCTGGATTCTGTGTATATCCTATTCGTTGAATTTATTTAGTCTCACATTTCTTTATTATCgtaaactatataaaattatgatataAAATCTGCGAGATATTTTACCATTCAAGAAGGGTTATTTTGctataatttttgttgttttcttttacgtATACATGTTgatgggaaaaaaaaaactctgatgtaaagataatatataaaatatgaaaaccaCTGTGTAATTTGGGATAAAGATGCCACCAGAAAGGGcccttttgttggtttttctCCTTTGTGGGGTCAAATTAGAAACTTGGAAATAGTTTTaagaatataatatatttttttaggaAGTTTAGGCCATTTCCATTGGTAAGATACtttaaaagtttctcaaaaaaaaaaaaaaaatattttactatgATTTAGTTTATGTCCAATaataaaca
|
GCF_000463585.1
|
NW_010960187.1
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| 1,445,654
|
+
|
CGCGCGAAAACCCATCTCCTCTCCCGCCGCACCTTCCctcctcttctcttctctttatTTTCATCTCTCCCTCACTGCTCCATCTCCCTCTTTCACCTCTATTACTCTCTCTCGCGGCGATGCAGCCTCAGCTCAGGCAGCCGTTGCCGCACATTTCTCCCTCCGCCGCAACGCGAAGAAGAATCGCGGGAGCTACAACTGCGGACGCTGTGGCCTACCGAAGAAGGGCCATGTCTGCCAAGTCGCTCCCGATGCACCCACCACACCGATCGCGAGGGATCCGTTGAGCTGCATCGCCGCCGCATCTTCCTCGCGCTCCACCATCCGCTCgttgccgccgccgccgccgcgcCAGGGGTACTCGCACCTCCGCCGCGCGCTGTCTTTCGACGACGTTGAAGCGTGTGACTCGCCGGACGAGTCCGATCTCGCCGCGGCGATGGATCCGGATCTAGATCTGCATTTGGATACTGATACAGTTCAACCGGGCGTGCCAGCCATGTGTTTGTGGG
|
GCF_000375325.1
|
NW_006238920.1
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| 12,661,869
|
-
|
CTGGTTCGAAAACCCTTTCACTGTATTTACTTCGATTGAAAGACGCTGGGATCTTGTGTGCTCAGACTCTTTCTACTTAATTAGAGGAGCTAGGGTTCGTACTCTGATTCtgggttttaattttgttgcaaTTGAAGCAGGATGAGAGATTCGAGATACACAAGGAGATGTACAGAGGGCAGCAGTACAGTCAGATTTACTTTGCTCGTCTTCATCTCATGAGAACACTTCTCTACTCTCTTGCCCCTACTTGGAAACCCCATTTGCCTGGTCAGTGCTTTgtttctctcatttttttgattacatgtttttttaactctACAAAGAGGAgcaattttgagaattttcttGGCTTTAGATATTATTTGGTGAAAATATCAGTATTTTGTTTAGGGATTACAGATAAGAAAGATTTTTAGTATTACTTTTCTGGGTAATTGAGGTGTTTAAATTATACATctaaaaatgtgaaatttcatttttgcaGTTTGTAAGGTTTTGGGACTTGAAGA
|
GCF_000150535.2
|
NW_019014505.1
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| 230,255
|
-
|
AGATTCtatattcttaaaaatacaCAATCCCTCTCCATTATGCCTCTTCGGAATTCTTCAGAGTTTCCTGATCCATATTTCATCCATTACTTGTAAGATCTGGATTCGCACTTTTCAGACAAACTTACATTGCAGAGCAATTGGGATTCAACTGGATTAAGTCAAGAAATTTTTAATGCATGTCCCATCTAGATTCTAGGTGTATTGAGACTTAAAAAATGATCTGAAACATTCCTTTGTCACCACAATATGTACATGTCGGCGAAATAATTTTTGTGGCACAAGTAAATCAACAGTTTAGACATGCTACGAAACTTCACCAAAAAGACATACAGATATGCATTCTACTGCTTGTTCAGTCAATAGTTGTCTCATTGATCGCATCACTTCCGCTAAGGACGATGGACCTGGGAGCCCATTCTGCTGTCCAGTTGTCTGCGGCATGAGACCAGATTCTACCACATTACTTCCATGAACAGGAGTAGCTTGTAAAATGTTTCCGTTAGCCCCTA
|
GCF_000150535.2
|
NW_019028612.1
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|
-
|
TGTGCTCCCCTAATGCTTCGTTTAGCGtacgctctctctctctctctctatatttcTCTTTCTCCATTTATGGGTTTTCATGGattcatgtttttctttttgggttttgcAGATGGCATTCAGCTGGGACTTTCGATGTGAAGACGAAGACAGGTGGGCCGTTCGGGACGATGAAGCACCCAGCAGAACTTGCTCATGCCGCCAACAATGGTCTTGATATTGCTGTCAGGCTTTTGGAGCCTATCAAGGAGCAGTTCCCGATCTTATCTTATGCGGATTTCTATCAGGTAATTTGTTATCATTGTTATTCATCAATGGAAGTTCTGTTTCTTTTTCCCTCTGTTTTCCCTTTTTGGCTACTTTTTGGGGTTTTGTAAAATGATCTTGGGTTCTGTCTTTGATGGGTGAAGTTGGCTGGAGTTGTTGCCGTTGAAATCACCGGAGGACCTGAGATTCCTTTCCACCCAGGAAGACCGGTCAGTGATTCTCCTTACTTTTGTTCCTTTATGTAT
|
GCF_000375325.1
|
NW_006238919.1
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|
+
|
GTGCCCCGGGGGGGGGggtcaaataaaacaattgtTGCTTTTCTATAATATTCAACTATCTTTGGgcacaaattataaatacgGAAACATTCGGGGgcctaatttgttttttttcccggCACGACGATTGATCGATCATCATCAATGGGGGTGAAGACGAGCCGAGACCGATAAACAATGGGAGAGCCTGCGATCCGTACCATCGTCGAAGCGATTCACTCTTCTCCGACGCAGGCCGTCGTCTATCTTTCCGGCGGTGCCTCTctggtttcactctctctctctctctttgctttgAGTGATAcgaaacctatatatatgtacatattcTCAGGCGTTAGGTTGGTTGATGTCGGTTCCTGGAGCTTCGAACACGCTTCTCGAAGCCGTGGTTCCTTATTCTAGTGTATCGATGGTCCAATTACTCGGAAGGGTTTGTTCTCTATTTATGGCAAaatcctcttctcttctcctttatCACCTACCTGATTTtgttccctctctctctctct
|
GCF_000150535.2
|
NW_019014682.1
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| 3,002,429
|
-
|
ggttattaccgtaggtttgtggaaggattttctagtctagctgcttccttgactcggctcacaaagaagaatatcaagtttgagtggaatgagtattgtgaaagaagttttttagagcTAAAGAAGCGGgtgactactgcacttgtgttggcATTGccaagtggatcggggggatatacagtttacagtgatgcctcctacctaggcctaagttgtgttttgatgcagcatgggaatgtcatagcctatgggtccagacagttgaagagttataagaaaactatcccacccatgatttagagtttgccgcaatcataaatgccttgaagacttgtcATCATTATTTGTatagggagacctttcagatctatactgatcataagagtttgaaatacatattcactcaaaacgatctcaacatgcgttagagaaggtggatagaacttcttaaggactatgattgcgacatttTGTATCACCTCGGTAAGGATAACGTGGTAGTTGATGCActa
|
Sviridis_726_v4.0.softmasked
|
Chr03
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| 46,038,016
|
*
|
TCCCTGTGGAAAAAGCAAAGTTAATAAAAAGTAATCACCATATTGCAATTCACTATTGTCATATTTACCTTCATCTTATCTTCAAGCTTCTCACAAAGAACTCTGTTGAGCTCTTGCACATCATGCTGCATGAAAGAATCATAAGTATCCCATCCAAAGGATTTGGTCAACTCTTTCGTAGCCACACTGTTGTCACTATACTGGAGCTTGTAAAAAAGGCTCTGAAGGGCTAGAGGAATACTCCCAGATGGCATGTCATTCTCAGTTGTTGGCATATGATATACAGCCTACAATAAACATTTAACCAAATTAGTTCAATATTCGGAGTTCAGACACTTCGAAAAAACATGTAGGATTGAACCATGCTTGACCTCACCTTTCTGAAGTATGGTATATGGTACAACGTTTGTAGGAGAGAGTTCATATAACAGGTAGCACCTTGATTCTTGAGACCTACATAACCTGTTTCTTTTTTCGAATCGTAAGTCCAATAATCAACCATTCTTCGCACA
|
Sviridis_726_v4.0.softmasked
|
Chr05
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| 45,983,488
|
*
|
AACTGGATCATGATGACGACAATCTTTTCATATCATCTACAAGGGTTTTGCCAGCTCCGACTGGCCAATTAATCATGTTATGTCTGTCTTACTGATGAGAATGATTCTCTTCAGGTAATTACTCAGATCTGGGTGCTACTGTTAGCAGGGCTTGGATTGGGTGCTTTGTTAGATGTGTGGGTAAGTCCTTAAGAAACTGATTTTGTGCACCAACAGGTTGGCTGTTCGCATATGTTCTAATGGTCTGCTTCATTTCAGGCAGGGCACGATTTTCCTATTGTTTTTTATCTTGCTGTGGGTGGTTCCTTACTTTCCTACATATATTCAGCACCACCTCTCAAGGTACTTGAGTGTTTCTTCTTTATACTGATTCTGATTTTTTAAAATTGTTTCTTGGACTATTCCTTTTGATTGAAAGATACTCACAAAACTTTATCATAAATTTTCAGCTCAAGCAGAATGGATGGATTGGGAACTTTGCTCTGGGTGCGAGTTACATTAGCTTGCCCTGG
|
Taestivumcv_ChineseSpring_725_v2.1.softmasked.subgenomeA
|
Chr5A
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| 619,116,544
|
*
|
CCCGGAGCCTCCAGAGGGTGCCATTATACCTCCAAAGGTATTTACTAACCCTATCTGCAATTTTTCCCATTCGATCCAAAAAATGGATTGGGTTCCGTTATCAAGGGATAACAGAACAGACACAACAAAAATCCATCCTTAAGCTGCCAACATAATAAGTTCTGAACAACAGAATAAAAAATGAAAAGCAGCTAACTCATACAACCAGGCTGAACCAAACTGCCAACAGCGGGCCCCTGACAAGCTCAAAACTCGAAAAAACATATTCCAGCATCCCATTTGTCTGGGCTGATCATAGTTCTCCAGATGAATCTTTAGCAGCATAACAAGACCTGGCCTCCAGAAGATCACAACCTTTTTTTATGCATCATCCTCCTGCTAACCTTGTGCGCGTTTAGCTTGATAATTAATACTTATTGGTGATAATTAAACATAAACATATTTAGTTTCTTGGTATTAATAGCATAATCATTTCTAGCTCAGCCTTTTAAACTTCTGCCTTGGATGGTAAA
|
Td-FL_9056069_6-REFERENCE-PanAnd-2.0a.sm
|
chr1
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| 256,669,696
|
*
|
TGGACGCCAGCGCCTTGACAAGCGAGAACACGCCGGACGCGCGGCAGGGCCCGCCGACGCCGTCCAGAGCCCGCAGGACCGCTCTCGCCGCGTCCTCCACGCTGCCGCTCCGTGACGAACCCGACGACGGCGCCAGGAAGGCGAACGCCCGGTCGGTCGGGGGGAGCCTCCGCTCCGACATGAGCGCCAGGGCGCGCGACATCGCGCCGTAGTCGGCCATCCTCCCGGCATTCTCGACGAGCAGGTTGTGCGCGCTGGGGCCGGGGAAGCCCCTGCCGAGGGAGGAGGCCCACGCGAAGAAACGCTCCGCGGGGACGCCGCGGTCCGTGAGCAATCGGAGGACGCTGGAGACGAGGCCGTGGGAGAGGGCGGCGGGGAAGAGGCGGTCGAGGTCGGCCTCGAGGCCTCCGCCGCCTGCGACGACGAggcgaacgatcgcgtctgaagcggcggcgtgggagctaccatacgcgtcgttgccgtgggaaacggagggcctgccggagaatgcc
|
GCF_000633955.1
|
NC_025688.1
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| 24,015,593
|
-
|
GTAGAGAAATGTTTTAGGATTAGAAATGAGAAAGAACAATGGCAATGCTTGTGTGTTCGTCTCTCTTAAATTGGGATTCAATATACACATTGTTTAGAGTAGATGGAGATAATGGATAAGTGAAGTAGTGGTCTTTCTCAATGCACAAAAACTCAATGATGAAAACATTTTTCACTCGATTGATTAAAGGAATCACACGCAAATAGAAGTAGAAAACAGGAAGAAGTAAAGATACAAGTGGAAATGAGGgcatattgtaaaaaaaaaaccatgagcCCGATTTctacattgttgttgtttgtggctaAGTTCAAACGTTGGCTGCACTTCTGAAGGAACCGAGGGACTTGGAACCTGATGCCCTTAGAACGAATTGGTGGTAGAATGCAGCAATCGCAGCCCCAATGAATGGTCCTACCCAGAATATCCACTGTAATTTACATAGaccagaaagaaacaaacaacatttcattatttttccgTCAAACCAATAGAAACATAATTTGATTAAG
|
Bdistachyon_556_v3.0.softmasked
|
Bd4
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| 34,255,872
|
*
|
GTGCATGATCCTTAATCAAGTAGTAATGTCCTAAATTTAATAAATATGTGTTTCGGTATGAAAATTATGAAACTAATATTGCCTTTTCCGGTTAATTTTTTTTAATGCTTTTAGAATAATTCGGTCCAAACAGGATGGCTTGAAAAAAGTATTGCAAATTTCAAGCAAGACTAGGATTTGAACCCAAGACCACTGATATGTACTGCCATGGCACAACCAAGCAGATAGTAGCATGTATGTGCTATTTCCCTCTTCCTATTTTATTTAAACATACCATGCGTAACTGGAGTCAGAGTTCTTGGCGGGCAGCTTTTTTCGGGCGCGATCTGGCGCTAACTCTTGGTGCGCCTGCCAATCTTATCCTGCGCGCCGGCGCCGCAGCTCACCCATATCCTTGAGCCCTCAACCGCTGCAGAATCAGGATTCTGAACAAACCCTCGATCTCCTCCGAAACTGATCTAGGGTTGCTGTGGGACGGATGCCCAGGTGCACATCGATCcctctgcttccct
|
Sviridis_726_v4.0.softmasked
|
Chr05
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| 40,441,344
|
*
|
ATCTGAGCCCTGAGAGCAGCGTGGTGGATGCTGGCGGCCCGTGGCCGTACGACCCGACGGAATTCTATCAGCTGCAGACCAACCCGGTGCCGGAGGCCCTGCTTTCGCAGTCGCCGTCGTTCGCATCATCGAACGGCAGCGGTGTTGCACTATCTGACGGCTTCGGGTCGTTGTTAAGCTCGTCTGGTGTTATGCCGGATGTTGGCTTGACTGATTTTGTTGTGCAGAGCCAGCAGGCTATGCAGTTCTGCCGCGGATTGGAAGAGGCAAGCAGGTTTCTGCCTGACGAGAGTAAGCTTGTGATTGATCTTGAGAAGCCAGCATCTGTTACAGGCTTGGTGGCTAATGTCAAAGAGGAGAAGAGGTTTGCTGAGGTGAAGACAGAGAAGGCTGATGTTGAGGCAGCAATTCACCGGGGGAAGAAGCATTTCTACGGTGATGACTTGGATGCAGAGGAAGGGAGGTGCAGTAAACATTCAGCATCTGCTATCGACACTGATCACCTTGTGCGA
|
GCF_000309985.2
|
NC_024802.2
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| 9,460,129
|
+
|
TttggaaaaatattttatttcaaaaaaatgtatattttatgtttttaagagaaaattgcaaattttaagaaaattaatttgttttattagatTACTATTGggtaaaaattgttaaaaattgaaaattacagaaaacgatAAATTTACTATAGTAATTTAATgcgttttcttaatatgtgtgaaatactaaaaaaatctatcttttAAGAACTGAGGGAGtagaaaattaaagaaaaaaaaaacagtaccCATCCACACTATCAAATTCAAAAGGAATCGACTTGTATACAAAATTTGAATTCTAAAGTAAAAGAGTTCAAATACAGAGCAGCCTCCATGGTGCTAGAGAGACACATATCATAGATGATATCAACCACAATGACGCTCCTCTTACATTTAGTCCTGTTGCTGTAATTTAAACAAATCTGAACTGTAATACTTATCATCTTAATAAGTATATGCTATATTGATTAAGATCTTAACGAGTCAATCAAACCTTGGCTCTTGCTGCC
|
GCF_000633955.1
|
NC_025685.1
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|
+
|
TTATCAATTTTTTGGTGGGTTGTTTTCCTTTCTCGTCTTCATTAACTATCATTCATGCCATTGGACACACAACACTTCTGATTAAGTACTctttgattttggagcttatTCTAACATTCCGTTGAACAGTTTTCAAAGATGGAGggaaagaagacaaaaacagagatGTTTCTACAAAGAGAGCGAAATGCTACTTTATACGCACAGACTCTACAGCTTCAATTGATATGGAAAAACCCTATATCTTTTCTGGGAAGTCAATCTATGAAGCTCGTATGCATTTTATGCATGTCCATACATTGTCGTCTTTGGCCAACTATATGGCAAGGTACTCCTGTTTTTTCCCCTGTTTGAGGGAAAACAAGTGCTACAGTTTCATCTTTGAACTCCTTGAAAGATCTTCCCTTATGTAATTCAAGTCACTTTTCTGTTTGTCAATGCTTCAggttttctttgattctttcgAAGACTAAGAAGCTTGAAGTTGATTTGACAGGAGTTAACTTCGAAAT
|
Taestivumcv_ChineseSpring_725_v2.1.softmasked.subgenomeA
|
Chr5A
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| 152,950,528
|
*
|
tgagctcgatctctcctcgcctaatatgatcctggatgaagtgataccggatctcaatatgcttcgtcttgaagtgttgcaccgggttgagagaaatcttgattgcactttcattgtcacaccaaagaggcactttgtcacaaatgacaccgtaatcctttaaagtttgcctcatccaaagtagttgtgcacaacaactaccggcagccacatactctgcttccatggacgagagagacacacaactccttcttcttggaagaccaactcactaaagagcaaccaagaaattggcaccctccggaggtggacttcctatccactttgtctcctgcccaatcggagtccgaatagcccacaaggttgaagttagatcctcttggataccataggccaaagtttggggtatgagccaaatatcgaaagattcacttgaccgccacatagtgactttccttaggtgcagcttgaaaccgtgcataaatccccacactcaacatgatatccggtct
|
GCF_000463585.1
|
NW_010967707.1
| 3,914,953
| 3,915,465
|
+
|
gttcGTGTGGGCACTGAATCCGAAAGGGTTGAGACTTGGTACCGTCTCTGAATTGTGGAGTCGAATGTGTAAATGTGTTCTCGTGATTTGATCGATGTAAATTATGATTTCCAAAGTTCCAATTTAATTCGGGTTGTAAATTATAATCGAATCCGGATCTGTTTGTCTGAAAGATTCGTTGACCTGATCAGGTTGTGTGATCAAACATTCTGAACAATGTAGACATTTTGGGTATGGTGTTAGGGTTTGTCAGTGTGTATATGCAGCTTTTGGAACATCTCTGGCCTCTCTGCCTGAATGTTTTGCGTTTCCCGTTTGATTCTTGAATCTGTTATATTAGTTctttgttatgttttttgtgtTGTGCAGACAAGTCTGATACATCATGGATCCTCCCGTTAAGGATATAGACCgatttcccgagaaaatcgaAGATGAGAAAGAGGGAGGACCCTCTTTCCATTGTGGTCTCTATGATACAGAAGTAGTTCACAAGATAGCACAAGCTTTTC
|
GCF_000633955.1
|
NC_025685.1
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| 7,496,694
|
-
|
TATAGCCAAATTCATAAAAATGCACCAGAATATTATGCATAAGCACAACACTTAAAGGGTGTGTTCCAGTGGGGATTGAGTAACTATTATACCTCATCAATAATTTTTTGCCGTTCAGGAGAGCCATACTTGGGTGGTGCCTCACGCGATTTAATAGCTAGTGTACGCCTCTCCTCCTTTGGATAATCTACAGAGCCCAGTGCTCCATTGGGACTTGTGGGCATGAATGCAATGAGAGCCACCAAAGCAGTCCGAACTGCAAAgtcaaaaaaactaaatcataagaacaaagagatgatatatatagttcaaacCTTGTGTAAATTACAAGTGTTACGTGGtcttgtagaaaaaaaaacataacagtTAAGATATAAGGTATCTTGTGACATGTTGTTGGTGTAAGGatcaatgaaaatataaaaagtcCAAGACTTTACCACTCCATGAAGGTTGCCAATGCTCGGGGTGGTAATTTGAAATGCTCAAACAAATCTTGGTATTGGTTTCAA
|
GCF_000633955.1
|
NC_025703.1
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| 8,050,993
|
+
|
GATGTATCACTAACCCACTCCCTCTCTTTGTTCAAGTAAAATCTCACTCTCCTCTCTTTTTAATAGTTTTGTAGAGTTTGGTTATAAAAAACTAATCGTGTTCGTAATTACAGGTAATATTCCTAAAGATGGCTCAAAAAGTTGAAGTAAAAGGAGGAAAAGGAGGCAACCAATGGGATGATGGACCGGAACACGATGTTGTGACCAAGATTCAGGGTGCAGCAGGCGGGAACGGCATTCAATATGTTAAGTTCGACTATGTTAAGAGCGGAAAAACTGAAGAAGCCCCTCTTCGCGGTGTCAAGGGCCGTAGTATCGCAGCTGACCCGGTTCTTATACTTCTTCCTTGTCCATTggtcttcttctcttattagtatatatatcgaaagtttctttttgaattattgatattttgatCATGACATCTACAGTTTGTGATTAACCATCCAGAGTAGCATCTAGTTTCGGTAGAAGGTTGGTATAACCCTGAAGGTCTCATTCAAGGGCTTAAG
|
GCF_000309985.2
|
NC_024801.2
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| 789,278
|
+
|
CTTGGTTGGTCGACTGTTGTGCCCTTCTGCTCTGCCTCAATGATGTTCTTGAGAACCCAATAGCCAGACTTCACTGTGTAGTGACCGGTCTTTGTATACTCCCAACTGTAGGTATCGTCCCCTTTGTCTCCGTGTAGGTTTATGTGAGCGATCTTAAGCTGTATTTCCAGAGGAAACAGGTTGCTTATCAGGCTCGTGTTCCATTCTTTCTTAGAACAAGACATCAGGTCGCTCACTTTCGTCTGTGGTGATAAGAGGTGACGATATTGCTCTGGAATGAGCTTTGTGGTATCAATGGGGTGCGCTGGTTTACTTCCTAACCATCTCTCTTGCCATATATTGGTGTTGTGGCCATTGCCTATTATCACTTTGGCCCCTTGTCTGATCAGCTGCTCAGCCGCATGCATACTTCTCCATGCGTAGGAGGGTCTTGATCCAATAGGAGCGTTTAGGGGGTCAATATTGCGGAAGTATCTGCTTTTAAAAACTCTGGCCAAGAGGGATTTAGGATG
|
Taestivumcv_ChineseSpring_725_v2.1.softmasked.subgenomeA
|
Chr1A
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| 538,771,968
|
*
|
TCATTGCGTGGTCAAGCATCAAAATATGGCCTCGGGTAAAGAAAGGTTGTTGGTTGTCATTGAACTCTTAGGGGATGTGGACGAAGAGGCATGGAAGAGGCTGCTGCATTCTGCTGAAAGTTGCATGACATGTGGGAGCAAAATCATAGTGACTAGCCGATCAGAGAAGATGGTCAGGTTTGGAACAGCGGAAGCTATCAAGCTAAGTTGTTTGTCTGAAGAAGCTTACTGGTATTTCTTCAAGATGCTTGTGTTTGGAAGCACGGATCCGGAGGAGCACCCAAGGTTAACATCCATAGCCATGGAGCTAGCCCTCAGGATGTGCGGATCTTTCATCTCTGCATGTGTTATTGCCACTTTACTGAGAGAAAATCTCAGTGCCTGGTTCTGGTGCAGGGTTCTCAGAAGCTTTAGGAAGTACATGCAGAAGAATTTATTGTTGTTCGGTGAATATCGTGACGTGGATAAGTCTCGGTATATTATGACCATTGCTGAAACACAGCGAGTTTCTA
|
GCF_000801105.1
|
NW_017353147.1
| 10,106,899
| 10,107,411
|
+
|
TGATAAAGATTTTAAttgcaaaaattataatacttaaactaaaatataaagtttcaagATTTTGGGCCTGTCTTAACCCAAACAGACTTAAGcccaaaatatccaaactcaAATAGGCTTAACCcgaaaaatctgattttttgggttcataaaattaaaacccaAACTCGATAATTTTTAGGGCCAAGCGGGTTAGAGCTGCAAGTTTCGACCCTAATTGACATGTCTAAATATAATAAGTAAGAAAAACTACATCTATctcattttcaaaaactaaaaacatatgattataaagatCAAACATCCGACGCGCGTATCAAGAGCTAGTATCTATTATTATCAGAgtacatatttttatagtaacagatataatttagagattatgggcctaaaatattttactgtaGGTGAAATTAGGAAACTATCCGATTGTAAAATAAACTCAAAGAGACTATAGCAAGTTGTGTGCCACTTGCCTGTTTTATCCCTACGAGAGGACACGTCCTCCAAAA
|
GCF_000375325.1
|
NW_006238921.1
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| 13,551,934
|
-
|
TGGCAGATTGGTAAGAATGCAGCAAAATGCCTCTGGTGCTAGTGCAGGTCAAGGTGGAAGCAATTTACCAGCGGAAACTCAAATCCATCAAGGCGCTCAAATTAGTGGGGCCAGTGGAACACATGACAGTGGTAACGCACATGGGCAAGAAAGTGATCGCTCCACTGGGGAGAATAATGTCCATCCTGGGAGTGATCAACCTATGCACCAAAGCAGCTCCGCTATCAAtgataataatgaaaacaCAGTGAGGCGGAATGGTGCATCCTTGACAATCTCTGCTGCGGGTGCTTTTGATGCTGCCAAAGATATCATGGAAGCTCTTAGGGGTAAACATAACAATTTAGCCAGTGAACTTGAGGTGATacttttttcctctatatacCAACTATATTAACTAAAGGTGCTCTGAAGACATAcaaaatttttgtagtaaagATGAATCAGAGGAATATACAAGGAAGAAGGATATAGCTTCGATTTAGATTCTGACTCAACCAAGCAGGTTCCTG
|
Bdistachyon_556_v3.0.softmasked
|
Bd5
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| 18,024,704
|
*
|
CCCATTTATCCTAGTTTCAAATGTTGGTGCTTTGACTTCCATTTGACTTTGCTTATCAGGACTCCCGAGTTTTTTTCCTATGTCTGCAAATCAAGCAAGTCATAATTTTTACGTTTTTCAATCCTCTATTTTAGATATGCATTTATGTATTCTTTATGCATTTCCATCCTCGTACTACGAGAATCCTACAAATTAAAGAGACTCTCAGGCATAGCAAAATTAGGCATCAACAGAGGAGATCTTCGCTCCCTACTGCAATGACTTCAACCATGACAAGTAGATGCGGGGTAACTTATTTTAAGCAAAAATTGCACGGGACAACTCAAGCTAAGGCCAACTCACATCATCAATTATCAATACATACTAGACAAATCATTCAGTTCTGGAAACAATAATCCCTAATAAGCAAGGTTTGTCCCTCGATCAAACTATCGATGACTAACTCGAAGCTAGCAATCGATGATACGCTATAATTGGCGACATGTTCCATAGAAGCAAGCAACCGCTTGGAG
|
GCF_000478725.1
|
NW_006256342.1
| 5,273,376
| 5,273,888
|
+
|
ttctttctccatttctaagttttcttcttcttctccaccttctcttcgaCCGCCGAAAACAGCCGCTCGTAATGCCCACAAAAAAGACTCTTTGGAATGTAAGAGAGGACcttctcttcttttgattGCGTCTTCGTCTTCCGGGTTTCGGGTTTATTGTTCTTATAATGATGTGTGATCTGGCTCGTTACATTCTTTTAGGAGCTCCCTTTTTGGTGCTCGTACGTTTGGCGTTTCTCGTGTCTTTAAGGTGTTTGTTAAAATGTCTCCTGCCTTAATGAAAGAAATGTTTGATAACACTACTTGTCTGCTCTAAGTCAGAAACTCTTTTCACTGTTCTTTTTAATGTGTTATTATGGTCAGATTGATTCTGCAGATTTGCGTCATTGATCCTCTCGGTGCCTTTTTTTCTTGTCCATACAATTCTGCTTCATAAGACACTTTTGGTCTTAACACACGCTTTGGCAGATAAAACAACTGATGATGTGGAGGTCGTAGATGATTGGGAAGAA
|
GCF_000633955.1
|
NC_025698.1
| 10,474,213
| 10,474,725
|
+
|
TAGATCAATCTTCAGGTAAAATAATCATCAGCAGTATCCAACAGATTACTCTGCCTTCTACTTTTATCTAAGAGAACGTCGCCAGTTAAGGACCTACGAAATCTTTGGTCACTCCCATGATATACGCTTTTGATTCATTCAGGTAGTGATAAGTTTCACATCACAAGTTTCTTTGAAATGGTTAGTCAAAAGTTCTAACAAATGTTATATCATGTTTCTTTCTTGGTGTATACTGTCCTTGCTGATAAATTCAAGGACACAGCTATCTATTTGAATCGAGATACCACCAGGAACCTTTTTCAAACCATGCTCTCTCATTGAGTTACGATGGCTCGAAGCAGACCAGAGATATCACCTACCTTTAAGAATCCAATAATCATTAAACCTCATTTTTCGCAGGCATTCTCTCAAATACCAAGAGGGCTAATTCCATATTCCCAGCTCTAGTCCGGaaacaacaatcaaccttgTCGGTTTCACTACTTCTATCAAATTTTAGTCAAATAAATTCT
|
HvulgareMorex_702_V3.softmasked
|
chr4H
| 551,688,449
| 551,688,960
|
*
|
TTCATAAGTTACATACATCTATGAGTTTTAAACCTCTTGCATCACTTTATTTCAGTACCACATCTACAGCCAAAAAGTTTATCCCCCATTCCGTGCTTGCTGTAATCGCATCTTGCACTGCAAAAATTTACCAAACTACTTATACTATCTTTCTCCTTTGCACAGTTTATTATCAACAGGGACCTGAAATTGTGCCCAACATTCAGCAAGTTAAAGACTTTGTTGCTTAGCAAATGGTGCCCTGGCATTGCTAGTGACCTCAATATATTAAGTTGCTTCCTCAAACATTCACCAATTTTGGAGAAGCTCACTCTCCAGCTTTCTGAGGTATTATGTTTGTGTACATGAACACCTTCTGTTACTGAAGTTGATAATTATCCATAGTTGACTGATGTAAGTAAAATATTTGAATGCTTTAGGAACCTAAAGTTCCTGTGAAAACACAAAGAAGTTACACTCCATCAAAGCAATCATTTGCATTCACCCATCTGAAGATCGTCGAGATCAAATGT
|
Bdistachyon_556_v3.0.softmasked
|
Bd5
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| 23,372,800
|
*
|
TCCCAAGTCACCGTGACAGACGACGAGGGTGCCGGTAAGGAGAGAGATTTCACTGTTGACCTCCCACCGGTGGTCGAGACTGCCAAAGATGAAGACACCATTTCCTCACCGTTGTTTGCCGGCATGCTTGATGATGCCATCAAATCCCTGTCCATGGACTCTATCACTGTGGAAACAATGCACAATAACAGTGGTGGTGAGAAGAACAATACTGAACCTGTGGCGGTGGAACAAGAGAAGGAAGAGAAGGACGTCAGTAAATCTGAAACACTGGGTAACCTTAGCCTAAGGAAGCTTAGAGTCAAGCTTAAGGAGACGGTGGCAGCAAACTCCATCATTATGGAGCCAATGGTGTCCATAGACTCAATCACTTTGGAACCAACGCACGATAACAGTGGCGGTGAGAAGAATGTTCCTGAACTTGTGGCAGTAGAACAAGAGAATGAAGTGAATGATATCAGTAACTCTGAAGCACTGGGTAACCTTAGCCTAAGGAAGCTTAGAGTCCAGCT
|
GCF_000478725.1
|
NW_006256812.1
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| 285,024
|
-
|
ttccaaaAAGAAATGTTTTAATATGTGGAAAATAGCAAGTATGAATAAGCTCTTGATCAGCATGACATTAAAAGATGATGTGTGGTTTCCGAAATAAGTAAGAGATGCTTAGAAGAATCTTTTGAGCTTTGTTTCACCTTAAAGACTTGGCCTTTTTAATTTCCAAGACCTGGAGCAAGGGAAAGGTATCATGAAAAGTTTGAAGTATAAAACTTTTATTTAAAGATACTGAAACAACAGTGCCCTTTTCTAGAAGAAACCAAAAGACAAAGATATAATCGTGTGAATTCTTCTCCTGTATTTTGAGAACCGAGAAACAGAACATTCAGTGATTTACCGAAAGACTATAGAATTTTTAATATTCTCAAAAACTTGGCCTTTTTCTAGACCTGGAGCAAAGGAAAAGTATCAGGTAAAGTGGGCATCTAACTTTCAATTAAAAGATGCTGAAACAATAACGTCCTTTTATAGAAGAatccaaaaaagaagaatataaCGACGAGTGTGAATCC
|
HvulgareMorex_702_V3.softmasked
|
chr7H
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| 487,319,296
|
*
|
TGGTCCATTTCATATTTCTAGCTTTGAGGGCGACGGATGGAAGACGGGATCCGGTGTTGGGCTGGACGGAGGAAGGGCACATCCAGCGATCTCCTACCATAAAAGCCTAAAACCTCTCCCTTATCCGACCCCCCTAAATTTTGTAAGGGATTAAACGTTTGCTCATCTAACACACATCACTATCCTAAAAATTTACTTTGCCATGGAGAGACCGGCAACAGTATCACGTATGTGTAACTCTCGAAAGAAACGATCAACGCAACAATTAACACGCCCACAATTAATGTGACAGCATCAGCCAACCAACTCTTCTACCACCAGCGCCAGTATTCTTTTGCAATAGGCAGCACGACTTCCTCGCATGGACGACCTTGCCTCTCCGGTCGGATTTTAAAAAGGCTTCGCTTGGAATTTGTCGTCTTCACACCGTAATCACCACGCGCGCAATACGCCGTCGACTTTGACTACCGACGCCGCAGCAGCTGCAGCAGCTGCTCCCGATCGAGCTACCC
|
GCF_000150535.2
|
NW_019014673.1
| 730,876
| 731,388
|
-
|
TCTAAACATTCacttatttaaaaagttaaaatttgagaaattttgtatttactaaaatgataattataaaTTGATGCATCATAACcaaacatgttttaattaaaaaaaaaaacatttagttCTCGTTTTGAAcgttttaactaatttttgcagattaaaaattaaaaaatatatatatatataaccgaccctaaattatttatttttagaatatgGAAGtcgtgaactttttttttttttaaaaaaagaaaaagaaatatcgtTATTGTATTAACGAAGGgttgtaattttgttttttaattttcttaattattaatcaattaattgtGTTCGTAGTTTGGCGTGTCTGCCATTGACAGCGGAGTGACACCCACGTGAATAAAGGATTAGAACAATTACGTGTCATCTACTAACTTTTGGATAACGACAAAATCCTATCGTCACCCTACACGTGTCTCAATCTCCATCCCCCTCTAAAAAATCTGTGCGCTCATCAGAagcttctcttttct
|
GCF_000478725.1
|
NW_006256829.1
| 10,834,498
| 10,835,010
|
+
|
AAAAAGATTAATGAACTTTAACCATTTATTATATAATCTAACATGTATAAAGCAAAAACATCAGCATATAGATAAATGTATAGGTGCTGACATGCTGTAAAGGCCTTAAATTAATGTTCAATTAAGTTCTCACTCATTGATTTTTCCATTAATTTATCTATTCAACtagaaataatttttttttgttattgttcAGTTAGGAATTCAGTTTGATTATCTTGTAGATGGGTGTACAgagaaaaccaaaataatCAGTGCCTAGACAAaaataatgttaaaaaaacataggaaATTAATAAAGTAGATCAATGTTTTCTAGCTGACaaatttttattcttcttaGAGTAAACTTATAGTTTTTGGCAGAAGAAGTAAAAGAAACGTGTACAGTATTaagaagagagaaacaaaTGTCAACACCAAAGAAGAGCCTTAAGAGAGCTTTTGCTTTACACTCTTCCCCTTTCTCCTTCAGCTTTACGAATTAAAAACACATAATCTCCATTTCTATT
|
Taestivumcv_ChineseSpring_725_v2.1.softmasked.subgenomeA
|
Chr7A
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| 357,565,440
|
*
|
GAAGGCTGGCAAGCGAAGAGTTGATAAGGATCACACGAGCAGTCTTCGACAACCAGCGCCCTTTTCAGGGCTCAACGCGGTGTTGCATACGGGTCACCGTGAGGCGAAAATCCGCCACAGTGAGGCGCGAATCACTAACGGGGATCCCCAGGTAGGTCGTGGGGAAAGAACCCAACCGGCAATTTAGCCTGTCCACAATAGCCTGTGCTTCCTCCGGGGGAACCCGAGAACCATcacttcgcttttatcgaagttgatggttaggcccgacatctgttggaagcacaggaggaggaacttcaggttagcaatgtcttggacggagccctccaccattattatggtatcatccgcatattgaaggagggagacccctccccctccgactaggtgggggacgatgccgcgaatatggctagcatccttggccttatcaaggatggatgccaggcatcaaccaccatgttgaacagaaacggcgagaacgggtcaccctaacggaccccacagag
|
Sbicolor_730_v5.0.softmasked
|
Chr06
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| 52,761,856
|
*
|
TGTTCTTCTGCGCCATTGTTGCCATGCTGACGCCACAAGCTAGGCTGGCTGTCGTTTTCTTGTGCCAGAACCAAGGGATTCGCTTCACATGGTCCCATTTCCGCAGGGCCGGCCTTTTGGCCCTTGGCGCACCGCTCCCAAAGCACCTGCGTCGAGGAACGAGGATTGTTGCAGAAATGAGTTCGTCGTCACCACCCTCCTCAACCACGTACTCGACTCCGAAGCGGTATTCCAAAGGAGAGGTATATACAAAACGATGGCACCGTGCTTTACTTCGTCTGGAGAACCACAGAATTTAGAAAAAGCTTTGCATGATAGAGATTCGTATGGAGAACCACAAAATCTAGAAAAAAGTTTTTTTGCATGATAAAGATTCGTCTTGGAGAACCACAGAATTTAGAAAAAGCTTTGCATGATGAAGATTCGTCAGGAGAACCACAAATGATAAAGTTTGGGAAAAAAGCTATGGATTTGGAGTACATGGCTCTTGTGAAAAACTAGTGCCGAGCGCA
|
GCF_000478725.1
|
NW_006256547.1
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| 1,307,589
|
+
|
GAAGCTACTGGATAAGGTAAAAAACATCAGCGACTCATCATCACTTGTGGGCACTAGGAGCTCCACAACGCTCAATGGATCGTCCTTTCTTATGGATAAAAAGCTCCCTGAATCAAAATGCTCGACCAAAGAAGACACTGGTTCTGGTCTGAGCAACGAGCAGTCGAAAAAAGACAAGATCCGTACAGCTTTGAAAATACTCGAGAGCGTAGTTCCGGGTGCCAAAGGAAACGAAGCTCTCTTACTTCTCGACGAAGCCATTGATTACCTAAAGTTACTGAAACGAGACTTAATCTCAAGAACCATTGCTAAACAAAAATCCCCCCACCACTCACTAGTCACAAGTCACCAACCTTGTTTGTAAAAGAGACAACATGGGGAACAAGAAATCTACTGACAGATAAGGCTTGAAGATTCTCACGAGTGAAAACGTGTGTGAAGTGGTTTTGGGTCCGTATCCTCTGCATCAGCTTTTTAGCTGTATATAGTGGACTACTTTAGGTATATATGCT
|
GCF_000001735.4
|
NC_003070.9
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| 11,644,645
|
+
|
ACGAAATTTCCTTAAACGAAGCACGGATAGAGGCAAGGGAACAGGGGATACAGGAAGTTAAGCATCAAATCAGTGAAGTAATGGAGATGTTCAAAGATCTGGCGGTGATGGTAGACCATCAAGGAACGATCGGTAAATCTCTGAAACGAAAAAAGCAACAGTCAAGAcctagaataaaaaaaacagtcaaGACCTAGAATGCTTTGAGTCCAATTCTCAATCctctttactttttatttttttattttttatttttttatttttttattattattattcttttaataCTAGTAGGTTCATGACCGAATTCTATAATCCCTCTTAGGCCCGAAAGTAcagcatgtaatattagtttcgtccTAACGTCGAACCGACGACCTCTAAGCTTCACCTAATATCTTTATCAATTGAGCTAACGACACTtgagttaaattttattttattgcaGATGATATAGATGAGAAGATCGACAATTTACGTTCAGCAGCAGCTCAGGGAAAGTCCCATCTCGT
|
GCF_000309985.2
|
NC_024804.2
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| 12,348,989
|
+
|
TTAGTAAAACAAGAATCAACTGGGACTGCGTTTACGGTAACTAGATtctttctccgcgctacgcgcggataatatatttaaatttgttatatttatcatttttatttgtatgtgaatttttatattaaattatatataactaatttttaaatttcattttttatatatttttagttcgaagtaagtatttctattatatgtaatacaattaactaataaaatatgaagaatcaagtccgagattttagagttatgtaaaaaaaatatttatgtatagaacataaattatcttattttaaaaaatcggAATCTCATATCGAATAAATtcacgaaaagaaaaagtactccaataacttacttaaaatataaaaccccctTTTCAAAATAAGCGTacgtaataatattttttacgtgtaatagttgaaaactaaCAATTGgatatcgatctagaatattattttaatatatctaatggtaaaatattaattgtaataaaaaattttgaattttgt
|
Sbicolor_730_v5.0.softmasked
|
Chr03
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| 59,732,480
|
*
|
AGCATGGCAAGCAAAAATTAGAAATTAAACATCTATGGCAGAAAACAAACAGAAGACCAATTAGAGCACTCGCACACAAAAAACAAATCAAACAAGAACTTCACAAAAAAAAACTGCTGAGCAATCACACTGGAGTAAATGCAATCTCTTGACCAATCAAAGTTTAGCACACTTTGACTCACGATAAGCATTGCTAGGTGCTGGACTAGTGCACAGAGCCGATGCACTTGATGCTGGACCGCCAGCACCTCGACCTGCAGCAAGAACAGAACCAGCAGCCGGATTTCTCTGTCTAGAAATCGAACTATGGGGTCTGAGTCCAACTCCAAAACGCTAAAAAAAACAGACAGAGTGCAGATCACACGAAGCGAGGGTACTTGGGGCCGAGCCAACCTGGGCAGTGGTGTGAGCACTAAGAGCTGGAGGGCTTGGCTCTTCACTCGACGTGGAACTAGAGACACAAGCAAGCGGCGAGCGCCGCTGTGAGGAGCGCGCACGGTGCCTGGCGCCGG
|
GCF_000001735.4
|
NC_003070.9
| 19,977,049
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|
+
|
acagTGATGAATCTCTTTGGATCTCATCAGCAGATCGCCCTGTCCAAGCGCTTAACCCGCTCAAGATAGATTCATTCACATAATAACCCGCAGCATAGACTTTGACACCGATGATAGCAAACTTTTTCTCCCTAAACCCTGAAAAAAATTATGCATTTTCATAGATAAATTCATTAATGGAAGGCTAAGAGCAAATTTATACGTATTTCATCTACACAAGATCCCACATTGATGTATAAAACCGTTGCaaaaagtttacattttcGAGGCTAAAAATAGTGCAGATATAGTCAAAACTAACCAGTGCCGAGCAAAGACAACGGGCTAGAACAACCCGGTAATGTCACTGATCTCTTAAACTTTACACTTGTAGCCGTTTCTTCAGCGTAGTCCTCTGCATTTCCAACTACACAAGCCACAGAGACCAAAATGAAAGTGGGCTAAAACTCAAATGCATTATAATTCTTTTCCAAAACGATTCCTTTGCTAACTCTAACACTGTTTCTTCAATC
|
GCF_000478725.1
|
NW_006256858.1
| 2,438,153
| 2,438,665
|
+
|
CTTCCCGGTGATCTAATGGACGAGAACAGAATGGGTAGTCAGTTTCAAGAGCCAGAGCAGCCGATGCAGAGCCTTGACACTATCATGCAGATTATATCAGAGGCTACGATTCCTGCTGTTCGAAACCGTTGCCTCGATGCTTTCATGGCGGACAATCTTGACGACCTTGACGATGACATGGATGACTTTGATTCAGAATCTGAGATTGATGTTGACAGTAGCGGAGAGATTGTTTACGCTCTCTGAGATTTCAGGACAAACTCTGTTTTGTCCCGTACTTTTCAGACACCCATCGGAGTTTTGTCTTGGCTCCTCTCTCTCCCATGTTCATTTTTGGACcgtttgttgttgttttttccTCTACAAACTTTTGGAttcacatacatatatatgttatgTATAATATATGTAATATATCTTTTATATATTCCTCTTTGTTTCATCACTATTGGCACATTTTACACAATGACCTTTTTTCGGTCAGAATACAAATGACATTAGATTTGAGGAAA
|
GCF_000478725.1
|
NW_006256829.1
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| 11,324,100
|
-
|
tctaccaaataaaaATACCAAATCTACAGAGCTGCATTGCACTTGTCTGTCTGTTTAGTGCCGCGGTTTTATACATGTAGATATGAAACTGCCCCTCCTTCATACCCTTCTTGAGCTCCGGTGGTGCCATATGTTTCAACAACAGCGGAATCATCCTCGCGTAGGGCTTCACAGACTCCTCCACCTCGCCTTTTCTGTATAAATCTGGAATGCAATCAAACACTCGGatcttttttttgggaatGTCGACCTCAACGGCTACCCAATGTTCGTTGTTCACGTTGTGGGCGATATACACGAAATCAACATCTGTCCCCCATTTCTTGTGTGTAGGCAAGTAATGGTCGTAGTGACCGTTGGCAACGTCCAAATAACCATCACTGAATAGCCAACTCTTCTCGTTTGGTAGAAATTTGTTTCGATAGTCTCCACACCAAACTCGACAAAAGATAGGATCAAGGAAAGCAACTCTTCCCCCTTTGTAAGGAGATGGATACCGCATAGACCGTTGC
|
GCF_000478725.1
|
NW_006256547.1
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| 179,613
|
+
|
GGAGGGCTGCAATCCCAGACAGGACGGTCATGGACGCCATTGGTGTGATCCTCTGCAATAGCCTGGCTGATAGGAAATGACCTCAAAGAGGTAGTACCCTCCGCATCTGCAATGAGGGTATTGGGGTGACAAGGCAGATCCAGCTCAGAGGAGCTCTTCAAAAGAATTGGCCACCGTGCTTTGTGACAGCAGATGTAGGGAGATGGAGGGGAGGAAGATGGGGAATAAGGAAGGGGGATTTCCTTTGGAGTGGCATAGAGAGAAGGTGACATCTGAGGACGACTGAATGTCTTTTCCTTCTGCTGATTACTTTCAAACTTGGCCACATCTGAAATAGGTGGCTTCCAATGAAGCGGTTTTGTGCTTGGGATTTCAAGGGGTTTGAAAGCTCCTGAATTTAGCGATCTATCCAAGGCGGCAGCACCAGAAGACGTAGGCATGGTTCTACATCATTCGAAATTTCCAATTAGAAATCAACCAGTTATCCAACAAATAGGAACAAAATCTCCCAA
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